中正大學資訊工程系教授黃耀廷着手建置「臺灣病原體在地資料庫」，讓臺灣在面對下一波傳染疾病時，能更快找出個案不明感染原因。（中正大學提供／張亦惠嘉縣傳真）
新冠肺炎疫情延燒1年多，不明感染源常讓大家心慌，中正大學資訊工程系教授黃耀廷長年研究感染微生物基因定序，看見醫院臨牀追蹤不明感染原因的困境，近期着手建置「臺灣病原體在地資料庫」，可望讓臺灣面對下一波傳染疾病時，能加快辨識感染病原。
「要知道是什麼病原體感染的，必須判讀基因序列，但背後一定要有龐大的微生物資料庫」黃耀廷說，這次臺灣新冠肺炎疫情中，病人染疫後常因免疫力下降而被其他病原體再侵入，不僅增加治療困難度，且還有難以判斷感染源的個案，突顯臺灣基因定序技術雖能一次完整掃描上億個基因碎片，但最缺少的還是一個全面性的在地資料庫。
黃耀廷表示，過去臺灣微生物基因定序大多侷限在如大腸桿菌、沙門氏菌等常見菌種，當遇到新亞種或罕見菌時，光是正確鑑定就有困難，即便鑑定出來，醫師依然仰賴歐美國家常見抗藥性的統計資料用藥，但所有病原體都有在地化的傾向，6年前與臺中榮總感染科醫師合作抗藥菌株研究，就發現臺灣有些病原體的基因序列和國外長得不太一樣，甚至發展出在地抗藥性的突變菌株，參考歐美資料治療的效果自然打折，於是讓他決定動手建立在地資料庫。
黃耀廷說，最近先從臺灣醫院常見感染微生物基因體開始，如克雷伯氏肺炎鏈球菌、結核分支桿菌等下手，並透過與全臺各大醫學中心臨牀試驗逐步擴充，微生物包含細菌、真菌、病毒，光是病毒株序列就有二百多萬條，資料量龐大繁雜，處理過程不只需要同時具備軟體和微生物專業知識，還得全盤瞭解感染科醫師判讀與治療準則。
該資料庫預計一年後完成，提供醫院發展精準醫療的一個新選擇，黃耀廷表示，不僅將幫助醫師即時找出重症或危險族羣感染的病原體，也能追蹤臺灣特有的抗藥基因，讓投藥更加精準，甚至當出現新興疾病時，用來比對相似的基因和可能的來源，以及預防疫情擴散。